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鼻息肉发病的机制目前还不清楚，主要认为与病原微生物、遗传因素、免疫机制和解剖异常有关系。病原微生物像病毒、细菌和真菌，它都可以破坏鼻黏膜上皮屏障入侵黏膜，导致黏膜上皮增生，形成黏膜的水肿，最终形成息肉。
第二，中鼻道微循环学说。鼻窦鼻道复合体区域的狭窄和局部黏膜的肿胀，可以导致鼻息肉的形成。
第三，变态反应。由于鼻息肉为嗜酸性粒细胞，大量的侵润，它通常与哮喘密切相关。有些阿司匹林耐受不良的一些病人可以有鼻息肉，并且多为双侧，术后极易复发，并且有一些患者是跟遗传有关系，导致了鼻息肉的反复的发作。
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