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肝脏彩超能检查出肝脏弥漫性的病变，主要包括有急性的病毒性肝炎、肝硬化、肝吸虫病、脂肪肝。肝脏叶性病变主要有肝囊肿、肝脓肿、多囊肝、肝包虫病。肝占位性病变包括良性的病变，肝血管瘤、肝细胞腺瘤、肝脏局灶性结节性增生、炎性假瘤。恶性病变包括原发性的肝癌和转移性的肝癌，还有小肝癌以及淤血关、淤血性肝硬化，肝破裂和肝移植的术前和术后评价。
胆道彩超可以发现胆结石、急性胆囊炎、慢性胆囊炎，胆系肿瘤包括胆囊癌胆道癌。胆囊息肉样病变，其中最常见的有胆固醇沉着症、胆囊腺肌症。除此以外，胆系超声还可以发现胆道蛔虫病和梗阻性黄疸。
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