有关专家说，有患者认为，腹泻必然是胃肠道细菌感染，因而一旦遇到腹泻便使用抗生素来治疗，引起药物的副作用。但是，除了霍乱、痢疾和一部分由大肠杆菌感染所引起的肠炎，确实是细菌感染，治疗时常常需使用抗菌药物外，还有一些类型的腹泻却并非是细菌感染胃肠道所致。
　　
　　其中包括腹部受凉引起肠蠕动加快；对乳品、鱼、虾及蟹等食物过敏引起肠的变态反应；肠腔内因存在大量未经消化而不能被吸收的溶质，引起高渗性腹泻；外出旅行或迁居外地生活，由于生活环境改变使肠道正常菌群的生活环境发生了变化，从而导致菌群失调引起腹泻；小儿因饮食不当，辅食增加过快过多造成腹泻等。由于这些类型的腹泻没有细菌感染存在，治疗方法不尽相同，使用抗菌药物应当慎重。
　　
　　专家指出，腹泻滥用抗生素尤其是广谱抗生素，还可能导致二重感染。因为在正常情况下，人体的皮肤粘膜和与外界相通的腔道，如口腔、鼻、咽、肠道等处，都寄生着一定数量的细菌。这些数量繁多的细菌，与人体既相互依存又相互制约，有益无害。如肠道的正常菌群，在食物的消化吸收过程中起着重要的促进作用，并对危害人体健康的致病菌有着强大的抑制作用，可以有效地抑制它们的生长繁殖。