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病情分析：扁桃体发炎引起发热伴有腰痛，可能是与细菌，释放内毒素至血液，导致患者发热和慢性肾小球肾炎等相关疾病有关。

处理意见：我们可以首先完善血常规，c反应蛋白尿常规等相关检查，明确诊断患者疾病先行，抗炎治疗，如患者扁桃体反复出现炎症，可以考虑手术切除。