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鉴别脑瘤和偏头痛的最直接的方法就是影像学检查，如头部CT、颅脑磁共振、脑瘤这里脑实质的病变是可以通过影像学检查，而临床上所指的偏头痛是没有脑实质病变的原因。在CT等影像学检查通常没有表现。
另外还可以从发病年龄和临床表现区分脑瘤和偏头痛。脑瘤患者以中年人居多，而偏头痛的发作通常是青年起病，脑瘤导致的疼痛通常呈持续性，休息不能缓解，而偏头痛发作呈阵发性波动要疼痛，每次发作大约持续4~72小时，偏头痛的病因尚不明确，目前认为与遗传、内分泌、代谢、饮食和精神因素有关。
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