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细菌性心肌炎在明确诊断以后，要到正规的心内科或者感染科治疗，对应的应用抗感染的药物来进行治疗，同时要注意患者的心功能。一般应用改善心肌代谢的药物，比如曲霉他嗪、辅酶q10等，同时患者要严格的卧床休息。
有些患者会出现心衰、心律失常的症状，一般需要应用改善心功能的药物。有些患者由于治疗不及时，在后期可能转变为心肌病，这种情况下，患者的生活质量会大大下降。所以说对于细菌性心肌炎的患者，在明确诊断以后要住院治疗，规范的抗感染、改善心功能等治疗。在至于以后患者也要尽量的卧床休息三个月左右，以避免心肌的进一步损伤。
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