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如果得了先天性肛门直肠狭窄可以行x线正位片确定直肠盲端，位置高低的传统方法，可以行倒立位摄片，还可以行瘘管造影。对会阴舟状窝会阴道瘘的患儿，可以经瘘口插入适当大小的导管，注入对比剂。
会阴肛门区放置金属标记，进行x线射频，测定直肠盲端的高低及肠腔扩张的情况，还可以行膀胱尿道造影、自尿道注入碘化钠溶液拍片，了解瘘管情况以及与直肠的关系，还可以行探针检查、应用探针检查窦道的走向、长短粗细，同时用指尖在肛门区触摸探针头，可大致了解盲端与皮肤的距离。
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