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巧克力囊肿和个人的免疫功能以及骨盆腔细胞化生不完全，或者是经血逆流，经期不正常这一类的因素是有关系的。巧克力囊肿主要是与免疫因素有关，如果免疫力比较差的人，子宫内膜细胞被植入不正常的部位，并且生长繁殖会造成子宫内膜异位，而表现出巧克力囊肿的现象。
和遗传因素也有着必然的联系，一般是家族性的比较多。巧克力囊肿这种疾病临床上可以看到母亲姐妹都有，因为子宫内膜最常沉积于卵巢，子宫的背面以及大肠表面等处，因此遗传因素也会有着一定的影响。
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巧克力囊肿和个人的免疫功能以及骨盆腔细胞化生不完全，或者是经血逆流，经期不正常这一类的因素是有关系的。巧克力囊肿主要是与免疫因素有关，如果免疫力比较差的人，子宫内膜细胞被植入不正常的部位，并且生长繁殖会造成子宫内膜异位，而表现出巧克力囊肿的现象。
和遗传因素也有着必然的联系，一般是家族性的比较多。巧克力囊肿这种疾病临床上可以看到母亲姐妹都有，因为子宫内膜最常沉积于卵巢，子宫的背面以及大肠表面等处，因此遗传因素也会有着一定的影响。