抗菌药物常见的不良反应主要有毒性反应、过敏反应、二重感染还有胃肠道反应等，具体如下：

　　1、毒性反应：如链霉素、氯霉素常有耳毒性。氨基糖苷类的抗生素常可会引起肾功能损害。如果使用一些抗真菌药物，还有大环内酯类抗生素以及抗结核药物，还可能会出现肝脏功能损害。

　　2、过敏反应：比如用药过程中可能会出现药物热、皮疹、瘙痒、肾炎、粒细胞减少、溶血性贫血、血栓性静脉炎、荨麻疹、血管神经性水肿、过敏性休克等。

　　3、二重感染：大剂量或者长期应用抗生素，特别是应用广谱抗生素，当敏感菌被杀灭或者被抑制，其他不敏感菌借机会大量生长繁殖。

　　4、胃肠道反应：如恶心呕吐、食欲不振、腹泻、腹胀、胃肠道不适等。再就是白细胞减少，容易引起感染。还有血小板减少、贫血等不良反应。有些抗菌药容易引起肾功能损伤，尤其是本身就肾功能不全的患者更容易使肾功能不全加重。